Posljednjih desetak godina John Malkovich pojavljivao se u filmovima koji zasigurno nisu na razini njegove glumačke kvalitete. „Drunkboat“, „Casanovagen“, „Supercon“, „Bullet Head“, „The Wilde Wedding“ samo su neki od njih i vjerojatno su se mnogi zapitali što mu to treba. Međutim, u intervjuu objavljenom u britankom listu The Guardian, Malkovich je objasnio zašto je posljednjih godina prihvaćao brojne uloge, i dobre i loše. Naime, u prosincu 2008. godine, Malkovich je izgubio gotovo cijelu svoju ušteđevinu. „Naš tadašnji poslovni menadžer investirao je gotovo sav novac koji smo zaradili u poslove osobe koja se zove Bernie Madoff“, priznao je Malkovich. Madoff, da podsjetimo, je 2009. godine osuđen na 150 godina zatvora zbog prevare tisuća i tisuća investitora u vrijednosti od 64,8 milijardi dolara. „Nestalo je sve što sam zaradio“, dodao je Malkovich.

Prisjećajući se trenutka kada je vidio na televiziji Madoffa u lisicama, Malkovich kaže kako se tada upravo vratio iz Mexico Cityja u New York. „Rekao sam svojoj supruzi ‘Idem do ugla po cigarete. Mislim da imamo mali problem s Madoffom“, kazao je Malkovich priznajući da je slijedećih nekoliko dana bio u stanju šoka. Na pitanje koliko je milijuna dolara izgubio Malkovich je odgovorio „Ne znam. Puno. Ne mislim da je to važno. Promijenili smo način života“.  U te promjene spada i prihvaćanje daleko više uloga u filmovima. „Morao sam raditi više, morao sam raditi cijelo vrijeme. I prestao sam plaćati drugima. Prestao sam plaćati prijateljima i obitelji.  Nekada smo trošili puno novaca producirajući filmove koji su gubili novac. To je zaustavljeno“. Kaže da je bio ljut prvih par dana. „Nakon dva, tri dana rekao sam samom sebi ‘Budi sretan što si živ, budi sretan što imaš posao’.

Njegov posljednji projekt je tv serija „Space Force“ koja se počinje prikazivati 29. svibnja na Netflixu.